Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMOD4Q9NZQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMOD4Q9NZQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD4Q9NZQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
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