Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF12Q9NZN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF12Q9NZN5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms