Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSD3Q9NYI0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSD3Q9NYI0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms