Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM260Q9NX78 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM260Q9NX78 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM260Q9NX78 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms