Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD4Q9NVD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD4Q9NVD3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms