Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRMQ9NS64 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms