Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNIP2Q9NS61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms