Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS4Q9NRS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS4Q9NRS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms