Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SEC31BQ9NQW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31BQ9NQW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms