Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms