Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCX3AQ9NNX9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCX3AQ9NNX9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms