Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRHQ9HD43 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRHQ9HD43 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms