Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XAB2Q9HCS7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XAB2Q9HCS7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms