Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRC6CQ9HCJ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRC6CQ9HCJ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms