Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMBIM4Q9HC24 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMBIM4Q9HC24 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMBIM4Q9HC24 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMBIM4Q9HC24 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms