Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POPDC2Q9HBU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms