Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMURF2Q9HAU4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMURF2Q9HAU4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms