Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNDIG1Q9H7V2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms