Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf42Q9H799 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C5orf42Q9H799 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C5orf42Q9H799 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms