Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C11orf49Q9H6J7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C11orf49Q9H6J7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C11orf49Q9H6J7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms