Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR8Q9H6D3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XKR8Q9H6D3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XKR8Q9H6D3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms