Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1DQ9H5J8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1DQ9H5J8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms