Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO44Q9H4M3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO44Q9H4M3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO44Q9H4M3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO44Q9H4M3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO44Q9H4M3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO44Q9H4M3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FBXO44Q9H4M3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms