Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S9

IKZF4, Zinc finger protein Eos, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF4Q9H2S9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKZF4Q9H2S9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKZF4Q9H2S9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKZF4Q9H2S9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms