Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EHD4Q9H223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EHD4Q9H223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms