Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MED28Q9H204 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED28Q9H204 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED28Q9H204 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms