Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIF3L1Q9GZT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms