Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZCCHC2Q9C0B9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms