Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms