Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP3Q9BZ76 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms