Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A5Q9BY07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A5Q9BY07 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms