Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF17Q9BXT8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RNF17Q9BXT8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms