Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD1Q9BXT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms