Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SF3B5Q9BWJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3B5Q9BWJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms