Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP4Q9BWG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms