Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK2Q9BVS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK2Q9BVS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK2Q9BVS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIOK2Q9BVS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms