Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPON2Q9BUD6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPON2Q9BUD6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPON2Q9BUD6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms