Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN3Q9BTN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN3Q9BTN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms