Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCMBPQ9BTE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCMBPQ9BTE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms