Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPS4Q9BT78 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms