Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM79Q9BSE2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM79Q9BSE2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms