Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF25Q9BQ70 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCF25Q9BQ70 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms