Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM7Q9BQ49 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms