Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms