Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP4Q96MN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP4Q96MN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP4Q96MN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms