Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT74Q96LB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT74Q96LB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.5 ms