Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KCNH8Q96L42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNH8Q96L42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNH8Q96L42 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms