Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJD4Q96KN9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJD4Q96KN9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJD4Q96KN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJD4Q96KN9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms