Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71F1Q96KD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71F1Q96KD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms