Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SUCLG2Q96I99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUCLG2Q96I99 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUCLG2Q96I99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms